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汉坦病毒威胁?从极地疫情看真空离心浓缩仪如何护航NGS建库

发布时间:2026-05-13     浏览量:7

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2026年4月至5月,一艘名为“洪迪厄斯”号(MV Hondius)的极地探险邮轮在大西洋航行期间,暴发了一场引发全球关注的汉坦病毒聚集性疫情。截至5月7日,世界卫生组织共报告8例病例,其中3例死亡,病死率高达37.5%。经南非国家传染病研究所和瑞士日内瓦大学医院确认,此次疫情的病原体为安第斯型汉坦病毒——这是目前已知唯一能够发生有限人际传播的汉坦病毒型别.


当此类高致死率、可在密闭空间有限传播的病毒疫情发生时,高通量测序(NGS) 是快速鉴定病毒亚型、追踪变异和溯源传播链条的核心技术。


高通量测序(NGS)检测步骤

NGS 基本流程可简化为 4 个核心步骤


核酸提取与检测:利用DNA和RNA在低盐溶液中的溶解度差异,先沉淀分离DNA核蛋白,再去除蛋白杂质,即可获得纯化DNA。


文库建构与文库检测:DNA片段加接头修饰的过程,包含末端修饰、添加接头、PCR扩增、质量检测等,完成建库。


上机测序:以Illumina测序平台为例,当单链化的文库片段进入测序平台的流通池之后,可以与流通池表面的寡核苷酸结合,从而进入测序过程。


数据分析:对原始数据进行过滤、比对参考基因组、变异检测等处理,最终解读出生物意义(如基因突变、基因表达量等)


如和确保建库的顺利完成?

通常在利用杂交捕获方法进行目的片段富集的测序中,需要在建库完成后对样品进行混合和浓缩。样品为DNA 片段,大小200-400bp,浓缩过程要求将500-2000 ng DNA 文库(20-100 uL)浓缩至无液体残留,样品之间无交叉污染,同时要求样品损失率低10%。


真空离心浓缩仪浓缩方案

利用真空离心浓缩仪可以在低温(避免DNA断裂)和真空环境下,温和地去除样本中的水分和有机溶剂的优势,最终满足上机要求。


浓缩时间和损失率测试

对不同体积样品的浓缩时间和损失率进行测试,结果显示平均损失率约为5%。在过度干燥实验中,回收率基本未受影响


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表1 使用吉艾姆真空离心浓缩仪干燥时间及回收率测试结果

交叉污染测试

取DNA 样品1(260bp,420bp,650bp 混合物)和DNA 样品2(750 bp)各4份进行以下操作:

(1)通过毛细电泳确认样品中DNA 片段大小和分布情况;

(2)样品1 和2 同时进行浓缩,摆放位置分别选取相邻和相对的空位;

(3)完全干燥后,加入50uL 水溶解,并重新进行毛细电泳检测条带

分布情况。

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表2 使用吉艾姆真空离心浓缩仪交叉污染测试结果


结果表明,真空离心浓缩仪凭借较高的向心力,可有效抑制样品底部沸腾,避免交叉污染。


吉艾姆Auto R3一体式浓缩仪技术优势:

专为NGS 测序而设计,内置水、乙醇溶液专用程序,浓缩速度提升20%

一体式,内置进口品牌隔膜泵

一次最高可浓缩180支1.5ml EP管,且无交叉感染。

两段温度控制设计,优化浓缩方案

离心腔特氟龙涂层处理,整机防腐耐用

操作简单,一键运行

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北京吉艾姆仪器有限公司作为中国离心浓缩技术领域的领先者,十年来始终专注真空离心浓缩仪的研发与制造,是该领域国内唯一的全产业链解决方案提供商。我们的产品广泛应用于生命科学、药物研发、化学合成与分析检测等高端领域,为敏感样品提供专业级保护。

如需详细技术资料或定制方案,欢迎致电咨询:  400-8030-186


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